生物肥中的一些根瘤菌和固氮細(xì)菌能吸收氮營養(yǎng)，增加土壤中氮的來源，而多種磷鉀溶菌可使土壤中不溶性磷鉀分解轉(zhuǎn)化為磷鉀化合物，增加作物生長環(huán)境中養(yǎng)分元素的供給。施用某些微生物肥料也能增加土壤中的有機(jī)質(zhì)，促進(jìn)土壤團(tuán)聚體結(jié)構(gòu)的形成，提高土壤肥力。

　　長期使用可以使原本相對壓實的土壤柔軟透氣，且保水保肥性能也得到改善。肥料中的有益微生物在作物根周圍生長繁殖，形成優(yōu)勢菌群，占據(jù)病原微生物的生存空間，防止病原微生物對作物的攻擊。

　　使用后，赤霉素、生長素等微生物等生理活性物質(zhì)，促進(jìn)作物生長發(fā)育，特別是根系發(fā)育。發(fā)達(dá)的根系增加了作物的養(yǎng)分吸收能力，促進(jìn)了作物的生長發(fā)育。特別是對一些光合細(xì)菌制劑，在作物葉片上噴灑后，作物枝葉繁茂，葉面積增加，增強(qiáng)了作物的光合作用，加速了作物生長，早熟，果實多，產(chǎn)量高。

　　微生物的活性使土壤養(yǎng)分供應(yīng)平衡，防止作物過度吸收氮肥。蛋白質(zhì)、糖、維生素含量增加，硝酸鹽含量降低，作物品質(zhì)明顯提高，口感好，保存時間延長。

　　生物肥具有良好的肥料效率，能提高作物的抗病性。微生物肥料的使用，可以減少化肥用量30%，同時減少農(nóng)藥用量，從而減少環(huán)境污染，減少農(nóng)藥殘留，促進(jìn)我國農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。