一般來說，腐爛的有機肥料需要兩個階段，即一個高溫堆肥腐熟發(fā)酵階段和二個陳化階段。在微生物的作用下，不穩(wěn)定的有機物通過腐爛過程轉化為穩(wěn)定的腐殖質。它的溫度變化可以定義是否腐爛。

　　先說一階段:通過比例原料基質，肥堆被高氧吸收，產生高溫，大量可降解揮發(fā)性固體，氣味逐漸降低，肥堆顏色逐漸變化，需要保持良好的曝氣和水分控制。

　　二次堆肥：氣溫初見下降，氧吸收率下降，氣味完全消失。

　　與一次堆肥分解相比，沒有二次堆肥是活不下去的，因為二次堆肥可以降解難以降解的有機物，重建嗜溫微生物菌落，有助于有機肥分解，減少植物毒性物質，抑制病原菌。

　　溫度上升階段：有機肥腐熟溫度上升至45℃，以放線菌、真菌和細菌為主，主要分解糖類和淀粉。甚至還有源生物和動物參與其中。

　　高溫階段：腐熟溫度達45℃上述，嗜溫微生物受到抑制，以嗜熱為主?？扇苄杂袡C物質繼續(xù)被氧化分解，復雜的有機物質(纖維素、半纖維素、蛋白質、木質素)也開始被分解。50℃大約60(嗜熱真菌和放線菌);℃左右(嗜熱細菌和放線細菌);70℃左右(大部分微生物已無法適應)。

　　好的腐熟溫度是55℃，因為大多數微生物在這個溫度下活躍，容易分解有機物、病菌、蟲卵、雜草種子，大部分都會被殺死。

　　降溫階段:嗜溫微生物再次開始大量繁殖，占據優(yōu)勢，進一步分解殘留難以分解的有機物。此時微生物活性下降，堆肥腐熟需氧量下降，溫度下降，肥堆逐漸穩(wěn)定。